- kmeň: Sarcomastigophora – meňavkobičíkovce
- podkmeň: Mastigophora – bičíkovce
- trieda: PHYTOMASTIGOPHOREA – rastlinobičíkovce
- rad: Chrysomonadida
- rad: Silicoflagellida
- rad: Coccolitophorida
- rad: Heterochlorida
- rad: Cryptomonadida
- rad: Dinoflagellida
- rad: Ebriida
- rad: Euglenida
- rad: Chloromonadida
- rad: Volvocida
- rad: Prasinomonadida
- trieda: ZOOMASTIGOPHOREA – živočíchobičíkovce (Prvoky)
- rad: Choanoflagellida – golierikovkotvaré
- rad: Bicosoecida – chobotnavkotvaré
- rad: Kinetoplastida – bázobičíkovkotvaré
- podrad: Bodonina – bodonidy
- podrad: Trypanosomanina – trypanozómy
- rad: Proteromonadida – proteromonádotvaré
- rad: Retortamonadida – retortamonádotvaré
- rad: Diplomonadida – diplomonádotvaré
- rad: Oxymonadida – oxymonádotvaré
- rad: Parabasalia – mnohobičíkovkotvaré
- podrad: Trichomonadida – trichomonády
- podrad: Hypermastigida – mnohobičíkovky
- trieda: PHYTOMASTIGOPHOREA – rastlinobičíkovce
- podkmeň: Opalinata – opaliny
- podkmeň: Sarcodina – koreňonožce
- nadtrieda: RHIZOPODA – meňavkovce
- trieda: HETEROLOBOSEA – slzovičkovce
- rad: Schizopyrenida – slzovičkotvaré
- rad: Acrasida – akráziotvaré
- trieda: LOBOSEA – lobopodiovce
- rad: Amoebida – meňavkotvaré
- rad: Leptomyxida – korienkotvaré
- rad: Acanthopodida – akantopodotvaré
- rad: Loboreticulatida – sieťovníčkotvaré
- rad: Testaceolobosida – loboschránkotvaré
- trieda: CARYOBLASTEA – pelomyxovce
- rad: Pelobiontida – pelomyxotvaré
- trieda: EUMYCETOZOEA – slizovkovce
- trieda: PLAZMODIOPHOREA – nádorovce
- trieda: FILOSEA – vláknonožce
- rad: Aconchulinida
- rad: Gromiida (Testaceofilosia)
- trieda: GRANULORETICULOSEA – granulovce
- rad: Athalamida – meňavkovkotvaré
- rad: Promycetozoida – plazmodiovkotvaré
- rad: Monothalamida – jednokomôrkotvaré
- rad: Foraminiferida – dierkavce
- trieda: XENOPHYOPHOREA – plazmodiovce
- trieda: HETEROLOBOSEA – slzovičkovce
- nadtrieda: ACTINOPODA – nitkonožce
- trieda: RADIOLARIA – mrežovce
- rad: Porulosida
- rad: Oculosida
- trieda: ACANTHARIA – akantárie
- trieda: HELIOZOEA – slncovky
- rad: Actinophryida
- rad: Centrohelida
- rad: Desmothoracida
- trieda: RADIOLARIA – mrežovce
- nadtrieda: RHIZOPODA – meňavkovce
- podkmeň: Mastigophora – bičíkovce
- kmeň: Labyrinthomorpha – labyrintky
- kmeň: Apicomplexa (Sporozoa) – výtrusovce
- trieda: GREGARINA – gregaríny
- rad: Archigregarinida – archigregaríny
- rad: Eugregarinida – eugregaríny
- rad: Neogregarinida – neogregaríny
- trieda: COCCIDIA – kokcídie
- rad: Procococcidida – prvokokcídie
- rad: Eucoccidida – pravé kokcídie
- rad: Piroplasmida – piroplazmy
- trieda: HEMATOZOEA – krvinovky
- trieda: PERKINSUSOEA – perkinsovky
- trieda: GREGARINA – gregaríny
- kmeň: Microspora – mikrospórovce
- trieda: MICROSPORIDEA – mikrospóry
- kmeň: Ascetospora – ascetospóry
- trieda: HAPLOSPOREA – haplospóry
- trieda: PARAMYXEA – paramyxy
- kmeň: Hemimastigophora – bičíkobrvce
- kmeň: Pseudociliatea (Primociliatea) – panálevníky
- kmeň: Ciliophora – nálevníky, riasničkavce
- trieda: KARYORELICTEA – karyorelikty
- trieda: SPIROTRICHEA – špirálobrvce
- podtrieda: Heterotrichia – heterotrichy
- podtrieda: Oligotrichia – oligotrichy
- podtrieda: Stichotrichia – stichotrichy
- podtrieda: Hypotrichia – hypotrichy
- trieda: LITOSTOMEA – litostómy
- podtrieda: Haptoria – chobotovky
- podtrieda: Trichostomata – vakovky
- trieda: PROTOSTOMEA – predoústočkovce
- trieda: PHYLLOPHARYNGEA – ústočkošvovce
- podtrieda: Phyllopharyngia – švovoústočky
- podtrieda: Chonotrichia – golierikovky
- podtrieda: Suctoria – cicavky
- trieda: NASSOPHOREA – črievičkovce
- trieda: OLIGOHYMENOPHOREA – máloblanovce
- podtrieda: Hymenostomatida – blanoústočkovky
- podtrieda: Peritrichia – kruhobrvce
- podtrieda: Astomatia – bezústočkovky
- podtrieda: Apostomatia – skrytoústky
- trieda: COLPODEA – kolpódovce
* V niektorých systémoch je možné sa stretnúť s členením ríše Živočíchy na dve podríše: podríša: Jednobunkové (Monocytozoa) a podríša Mnohobunkové (Polycytozoa)
Učebnica 3 pre gymnáziá používa rozdelenie na 5 ríš a teda aj samostatnú ríšu jednobunkovce.